Банки данных Swiss-Prot и UniProt.

Данные банка Swiss-Prot о белке RUVA_ECOLI

Описание поля

Метка поля (line code)

Значение

Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P08576

Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности) ID RUVA_ECOLI

Название белка, отражающее его функции DE Геликаза ruvA, разделяющая структуры Холидея (Holliday junction DNA helicase ruvA)

Дата создания документа DT 01-AUG-1988

Дата последнего исправления аннотации DT 01-FEB-2005

Название организма OS Escherichia coli, Escherichia coli O6, Escherichia coli O157:H7

Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia

Длина последовательности SQ 203 а.о.

Молекулярная масса белка SQ 22086 г/моль

Число публикаций, использованных при создании документа RN 14

Название журнала с самой свежей публикацией RL Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.

Описание вторичной структуры FT Описание содержит перечисление номеров аминокислотных остатков, формирующих α-спирали, β-листы, повороты.

Что содержит поле комментариев? CC Содержит описание строения (является гомотетрамером) и функций белка (то есть то, что комплекс его с ruvB в присутствии АТФ взаимодействует с ДНК), а также дополнительную общую информацию о белке (принадлежит к семейству ruv и экспрессия гена, кодирующего этот белок, происходит в условиях повреждения ДНК). И, кроме того, предупреждение об авторских правах на информацию.

Какие особенности последовательности указаны? FT Указано на наличие "конфликта", то есть расхождения представлений разных исследователей на состав белка, например, в RUVA_ECOLI под номером 166 находится либо аланин, либо аргинин. Также эта графа содержит полное описание вторичной структуры.

Идентификатор файла PDB DR 1BDX;1C7Y;1CUK;1D8L;1HJP

За более подробной информацией о белке RUVA_ECOLI обращайтесь в банк данных Swiss-Prot.

Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и RUVA_ECOLI

Поиск производился с помощью поисковой системы SRS. Для поиска использовалось поле Description ; для вывода полученных данных выбирались поля Taxonomy и Description .

Таксон

Запрос

Количество найденных документов

Археи (Archaea) ((((([uniprot-Description:Holliday*] & [uniprot-Description:junction*]) & [uniprot-Description:DNA*]) & [uniprot-Description:helicase*]) & [uniprot-Description:ruvA*]) & [uniprot-Taxonomy:Archaea*]) 0

Бактерии (Bacteria) ((((([uniprot-Description:Holliday*] & [uniprot-Description:junction*]) & [uniprot-Description:DNA*]) & [uniprot-Description:helicase*]) & [uniprot-Description:ruvA*]) & [uniprot-Taxonomy:Bacteria*]) 147

Эукариоты (Eukaryota) ((((([uniprot-Description:Holliday*] & [uniprot-Description:junction*]) & [uniprot-Description:DNA*]) & [uniprot-Description:helicase*]) & [uniprot-Description:ruvA*]) & [uniprot-Taxonomy:Eukaryota*]) 0

Описание поля	Метка поля (line code)	Значение
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа	AC	P08576
Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности)	ID	RUVA_ECOLI
Название белка, отражающее его функции	DE	Геликаза ruvA, разделяющая структуры Холидея (Holliday junction DNA helicase ruvA)
Дата создания документа	DT	01-AUG-1988
Дата последнего исправления аннотации	DT	01-FEB-2005
Название организма	OS	Escherichia coli, Escherichia coli O6, Escherichia coli O157:H7
Полное название таксона	OC	Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Длина последовательности	SQ	203 а.о.
Молекулярная масса белка	SQ	22086 г/моль
Число публикаций, использованных при создании документа	RN	14
Название журнала с самой свежей публикацией	RL	Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
Описание вторичной структуры	FT	Описание содержит перечисление номеров аминокислотных остатков, формирующих α-спирали, β-листы, повороты.
Что содержит поле комментариев?	CC	Содержит описание строения (является гомотетрамером) и функций белка (то есть то, что комплекс его с ruvB в присутствии АТФ взаимодействует с ДНК), а также дополнительную общую информацию о белке (принадлежит к семейству ruv и экспрессия гена, кодирующего этот белок, происходит в условиях повреждения ДНК). И, кроме того, предупреждение об авторских правах на информацию.
Какие особенности последовательности указаны?	FT	Указано на наличие "конфликта", то есть расхождения представлений разных исследователей на состав белка, например, в RUVA_ECOLI под номером 166 находится либо аланин, либо аргинин. Также эта графа содержит полное описание вторичной структуры.
Идентификатор файла PDB	DR	1BDX;1C7Y;1CUK;1D8L;1HJP

Таксон	Запрос	Количество найденных документов
Археи (Archaea)	((((([uniprot-Description:Holliday] & [uniprot-Description:junction]) & [uniprot-Description:DNA]) & [uniprot-Description:helicase]) & [uniprot-Description:ruvA]) & [uniprot-Taxonomy:Archaea])	0
Бактерии (Bacteria)	((((([uniprot-Description:Holliday] & [uniprot-Description:junction]) & [uniprot-Description:DNA]) & [uniprot-Description:helicase]) & [uniprot-Description:ruvA]) & [uniprot-Taxonomy:Bacteria])	147
Эукариоты (Eukaryota)	((((([uniprot-Description:Holliday] & [uniprot-Description:junction]) & [uniprot-Description:DNA]) & [uniprot-Description:helicase]) & [uniprot-Description:ruvA]) & [uniprot-Taxonomy:Eukaryota])	0